Hola,
Es posible que estés utilizando una version de LibreOffice muy antigua; a partir de LibreOffice 5.3 el soporte de DOCX se mejoró drásticamente. Te recomendamos descargar y utilizar la última versión disponible en https://www.libreoffice.org/
Si mandas un DOCX de ejemplo a contact[at]phpdocx.com, lo transfomaremos utilizando la última versión de LibreOffice para que puedas comprobar su resultado final.
Con respecto a los anchos en tablas, ten en cuenta que es necesario especificarlos y no utilizar valores automáticos. En https://www.phpdocx.com/documentation/conversion-plugin/preparing-the-templates-for-its-conversion puedes leer más recomendaciones para obtener la máxima calidad posible.
Saludos.